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    笛卡儿的宗教信仰在学术圈中一直被严格地争论著。他声称是虔诚的罗马天主教徒，以及「沉思」的目的是為了维护基督教信仰。

    但是在他自己的时代，笛卡儿被指控宣扬秘密的自然神论和无神论信仰。与他同时代的布莱兹、帕斯卡说，「我不能原谅笛卡儿；他在其全部的哲学之中都想能撇开上帝。然而他又不能不要上帝来轻轻碰一下，以便使世界运动起来；除此之外，他就再也用不著上帝了。」

    史蒂芬、高克罗格的笛卡儿传记中写到，「他作為一个天主教徒有著很深的宗教信仰，并一直保持到他死的那一天，并带著坚定的，热情的探索真理的渴望。」

    在笛卡儿死於瑞典后，克里斯蒂娜女王放弃了她的王位转信罗马天主教（瑞典法律要求统治者是新教教徒）。

    她一直联繫的仅有的天主教徒就是笛卡儿，他曾是她的个人家庭教师。

    笛卡儿被广泛认為是西方现代哲学的奠基人，他第一个创立了一套完整的哲学体系。

    哲学上，笛卡儿是一个二元论者以及理性主义者。笛卡儿认為，人类应该可以使用数学的方法——也就是理性——来进行哲学思考。

    他相信，理性比感官的感受更可靠。（他举出了一个例子：在我们做梦时，我们以為自己身在一个真实的世界中，然而其实这只是一种幻觉而已，似如庄周梦蝶）。

    他从逻辑学、几何学和代数学中发现了4条规则：

    1、绝不承认任何事物為真，对於我完全不怀疑的事物才视為真理；

    2、必须将每个问题分成若干个简单的部分来处理；

    3、思想必须从简单到复杂；

    4、我们应该时常进行彻底的检查，确保没有遗漏任何东西。

    笛卡儿将这种方法不仅运用在哲学思考上，还运用於几何学，并创立了解析几何。

    由此，笛卡儿第一步认為怀疑就是出发点，感官知觉的知识是可以被怀疑的，我们并不能信任我们的感官。

    所以他不会说「我看故我在」、「我听故我在」。从这裡他悟出一个道理：我们所不能怀疑的是「我们的怀疑」。

    意指：我们无法去怀疑的，是我们正在「怀疑」这件事时的「怀疑本身」，只有这样才能肯定我们的「怀疑」是有真实性的，并非虚假的產物。

    人们觉得理所当然或习以為常的事物，他却感到疑惑，由此他推出了著名的哲学命题——「我思故我在」（cogitoergosum）。

    笛卡儿将此作為形上学中最基本的出发点，从这裡他得出结论，「我」必定是一个独立於肉体的、在思维的东西。

    笛卡儿还试图从该出发点证明出上帝的存在。笛卡儿认為，我们都具有对完美实体的概念，由於我们不可能从不完美的实体上得到完美的概念，因此必定有一个完美实体——即上帝——的存在来让我们得到这个概念。

    从所得到的两点出发，笛卡儿继续推论出既然完美的事物(神)存在，那麼我们可以确定之前的恶魔假设是不能成立的，因為一个完美的事物不可能容许这样的恶魔欺骗人们，因此藉由不断的怀疑我们可以确信「这个世界真的存在」，而且经由证明过后的数学逻辑都应该是正确的。

    现实世界中有诸多可以用理性来察觉的特性，即它们的数学特性（如长、宽、高等），当我们的理智能够清楚地认知一件事物时，那麼该事物一定不会是虚幻的，必定是如同我们所认知的那样。

    虽然笛卡儿证明了真实世界的存在，他认為宇宙中共有2个不同的实体，既思考(心灵)和外在世界(物质)，两者本体都来自於上帝，而上帝是独立存在的。

    他认為，只有人才有灵魂，人是一种二元的存在物，既会思考，也会佔空间。而动物只属於物质世界。

    笛卡儿强调思想是不可怀疑的这个出发点，对此后的欧洲哲学產生了重要的影响。我思故我在所產生的争议在於所谓的上帝存在及动物一元论(黑猩猩、章鱼、鸚鵡、海豚、大象等等都证实有智力)，而怀疑的主要思想，确实对研究方面很有贡献。

    笛卡儿对数学最重要的贡献是创立了解析几何。笛卡儿成功地将当时完全分开的代数和几何学联繫到了一起。
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